四川BD VDJ单细胞转录组测序

单细胞测序结果动辄上百G数据量，庞大的数据对于分析平台和分析能力有着很高的要求，首先针对下机数据的质控环节：单细胞测序产生数亿的结果序列，不可避免的会出现低质量的测序结果，存在各种情况的序列污染。因此序列过滤及质量评估就会变得极为重要。序列质量主要通过测序质量值Q20/Q30的占比来表征，即碱基测序结果的错误率在1%/0.1%以下的比例。理想的测序结果reads的碱基质量均高于30。保证数据获得后的处理结果的准确性，为后续细胞类型鉴定和功能分析打下坚实基础。烈冰一站式单细胞测序服务：立足科学研究，解码生命本质。四川BD VDJ单细胞转录组测序

烈冰生物BDRhapsody平台，采用精简的工作流程助力您的实验成功：1.制备单细胞悬液：可使用碧迪医疗单细胞多样本分析试剂盒和/或BDAb-seq寡核苷酸偶联抗体(Ab-Oligos)将细胞染色2.微孔板预充和处理:使用自动移液器进行液体交换3.单细胞捕获工作流程:(1)细胞上样:上样575微升细胞悬液；系统未采用微流体通道设计，无需担心通道堵寨；通过重力轻轻沉淀细胞，可捕获脆弱细胞，BDRhapsody微孔板包含大于220,000个分区，可在低双细胞率下捕获多达40000个细胞(2)细胞上样扫描：估算捕获的活细胞数量和细胞多态率(3)磁珠上样：微孔的正六边形几何形状和尺寸可防止磁珠多重分配在微孔中(4)磁珠上样和磁珠洗涤扫描：估算包含活细胞和磁珠的微孔数量；测定细胞存留率，评估是否发生细胞损失(5)细胞裂解：使用裂解缓冲液，确保细胞完全裂解(6)磁珠回收：轻松、高效地磁性回收磁珠并采用Scanner扫描磁珠回收情况无锡BD VDJ单细胞实验平台单细胞测序技术的迅速发展和应用推广，为从多维度揭示疾病发展提供了强有力的工具。

单细胞获得困难，不同组织要求不尽相同难以搞定？烈冰2000+项目消化经验，100+组织类型解离protocol，精心设计不同组织实验的解离、细胞悬浮实验体系，确保单细胞的获得。冻存样本无法实验，珍贵样本无法使用？烈冰采用国际认可的冻存组织复苏技术以及死细胞过滤技术，确保冻存组织使用。珍贵样本，细胞数量太少，消化背景杂无法做单细胞？采用国际认可的10XGenomics，BDRhapsody双平台模式，根据样本实际情况和用户需求提供客观有效的实验方案,细胞量少，背景杂也能做单细胞。单细胞RNA分类精度不足，部分细胞无法细分？烈冰同时采用单细胞蛋白质组与单细胞转录组测序技术，真正做到从上游到下游的全流程检测，确保超高的细胞分类精度。

根据烈冰多年单细胞测序服务经验，为什么不建议您一味的追求高细胞数量的捕获：单细胞测序所有的分析都是基于细胞聚类进行，而细胞聚类是在区分cell和non-cell后，获得细胞基因表达谱，通过降维（pca），无监督聚类以及可视化（t-SNE）得到的。进行细胞聚类时需要考虑到每个细胞的基因表达模式，因此即使是相同的数据，在剔除几个细胞的情况下，前后获得的聚类图也会出现明显不同。而当细胞捕获数过多时，无论是假阴性和假阳性数据还是多细胞数据，都会对正常细胞聚类产生影响，造成聚类结果失真。这也是很多文章，特别是很多高分文章，为什么单个样本捕获细胞数在2000-3000的原因了。烈冰建议单个样本捕获细胞数在3000-5000个时，数据量在100G左右时，可以满足分析和文章发表的多重需求。BD Rhapsody平台在细胞捕获过程中没有偏好性，可同样无差别捕获中性粒细胞。

烈冰生物单细胞测序服务，为您提供可视化质控系统，保证每次实验的可靠性：BDRhapsody扫描仪具有直接成像功能，可在工作流程的不同阶段进行质量控制，如细胞捕获率和细胞多态率（双细胞率）。成像仪指标可以确认起始细胞样本的质量，并确认微孔板工作流程中每个步骤的成功完成状态；在细胞裂解前的步骤中评估细胞活性；并对通过测序确定的细胞回收量进行可靠估算。利用这些信息，在进行高成本的下游测序之前，用户可根据需要改变方向并解决实验中遇到的问题。这些指标允许用户对不同工作日间的或者不同研究中心间的工作流程性能进行跟踪。烈冰测序服务已助力300余篇国际期刊研究文章发表。深圳单细胞服务机构

BD单细胞测序平台同时兼容单细胞蛋白组测序（Ab-seq）和免疫组库测序等工作。四川BD VDJ单细胞转录组测序

多样本数据合并：FractionofReadsKept：合并样本时，各样本根据MappedBarcodedReadsperCell数量计算出来的数据利用率。如果各样本间该参数值相差很大，需要进行Downsample处理，以数据量少的样本为基准将不同样本中细胞测序深度标化到同一水平，从而避免因测序深度差异导致的基因检测数量、基因表达水平的差异。烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据，深度解读数据分析结果，深入挖掘其背后的生物学意义；从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究，加速科研进程！四川BD VDJ单细胞转录组测序

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